Vogels
Saeftinghe staat bekend als vogelrijk gebied. In het gebied broeden onder andere tureluurs, graspiepers, gele kwikstaarten en rietgorzen. Ook minder algemene soorten komen hier tot broeden zoals het baardmannetje, blauwborst, snor en soms het porseleinhoen. Saeftinghe is het belangrijkste broedgebied voor de graszangers in Nederland.
Deze zuidelijke soort bereikt de noordgrens van zijn broedgebied hier. In goede jaren na een zachte winter zitten er soms wel meer dan 50 paar.
Daarnaast is het gebied belangrijk als treklocatie. De slikken vormen een waar buffet voor trekkende steltlopers als de bonte strandloper, drieteenstrandloper en zilverplevier. Deze en andere soorten steltlopers zijn er soms met duizenden te zien. Jaarlijks trekken hier in de winter grote groepen eenden en ganzen langs. Ze gebruiken het gebied om te rusten en voedsel te zoeken. In deze periode overwinteren er ook tientallen bruine- en blauwe kiekendieven, een honderdtal baardmannetjes en duizenden oeverpiepers. Bijzondere wintergasten zijn slechtvalk, zeearend en ruigpootbuizerd. Het hele jaar door zijn soorten als kleine zilverreiger, grote zilverreiger, bergeend en scholekster hier aanwezig.
Planten
De variatie in zoete en zoute bodem zorgt voor een diverse plantengroei. De schorren hebben een zilte ondergrond. Hier groeien zilte planten zoals zeeaster, heen, melkkruid, schorrenzoutgras, gewoon kweldergras en zilte rus. Maar ook het zeldzame lepelblad groeit hier. In het oosten van Saeftinghe is de invloed van zoet water groter. Hier vind je grote rietvelden. Nergens in Zeeland zie je zulke grote rietvelden. De rietvelden zijn vooral van belang voor vogels.
Insecten
In Saeftinghe leven bijzondere insecten. Dit zijn soorten die vaak in een bepaalde omgeving voorkomen of zelfs gebonden zijn aan een specifieke plant. Zo leeft hier de schorzijdebij. Deze solitaire bij graaft een nest in zandige ondergrond en leeft van zeeasters. Ook komen hier de schorviltbij en graafwesp voor. Op de dijken en dammen in en langs Saeftinghe worden vaak grote aantallen trekkende en zwervende dagvlinders gezien. Soorten die we hier onder andere zien zijn hooibeestje, kaasjeskruiddikkopje en bruin blauwtje.
Onderwaterleven
In het brakke water dat door de geulen in Saeftinghe stroomt, leven veel verschillende onderwaterdieren. Het gebied heeft een belangrijke kraamkamerfunctie voor vissoorten als schol, bot en zeebaars. Spectaculair zijn de duizenden volwassen dun- en diklipharders die hier in de geulen naar eten zoeken. Daarnaast leven er verschillende soorten krabben en garnalen de geulen van Saeftinghe.
Soorten die hier voorkomen zijn onder andere de gewone zwemkrab, blauwe zwemkrab, gewone garnaal en verschillende soorten steurgarnalen. Ook schelpdieren zijn hier in grote aantallen. In totaal leven er tientallen soorten waaronder verschillende soorten mossels, de Japanse oester, het wadslakje en de kokkel.